Zum allgemeinen Sachbuchprogramm gehören die Programme Leben & Gesellschaft, Religion und Spiritualität, Taschenbuch, Geschenkbuch, Kreuz sowie Urania. Herder Kinderbuch mit dem Kerle-Verlag ist bereits 2012 nach München umgezogen. Dort sollen künftig etwa zwei Dutzend Mitarbeiter aus Lektorat, Marketing und Presse unter der Leitung von Tobias Winstel arbeiten, der im Mai 2013 die neugeschaffene Position des Verlagsleiters Publikumsmarkt bei Herder übernommen hat. Durch die Konzentration soll der eingeschlagene Modernisierungsprozess beschleunigt und intensiviert werden. „Mit dem geplanten Umzug nach München wollen wir uns einen bedeutenden Medienstandort erschließen“, erläutert Verleger Manuel Herder.
In Freiburg sollen die beiden Fach- und Zeitschriftenverlage für Theologie und Pädagogik sowie der Bereich Online weiter ausgebaut werden. Beispiele dafür sind die in den letzten Jahren gegründeten Zeitschriften „Einfach Leben“ und „Kleinstkinder“. Ebenso in Freiburg bleiben der Vertrieb und der kaufmännische Bereich des Verlagshauses.